本发明属于色谱分离技术领域，尤其是一种木糖水解浓缩色谱脱盐的系统及方法，针对背景技术提出的树脂利用率低，消耗水资源多的问题，现提出以下方案，包括色谱柱、罐体、泵、换热器、过滤器。本发明相对连续的进料、出料，减少了上下游贮罐子的体积，生产过程中进料基本上不会被回路上的物料稀释，同时分离完成的提取液与提余液被选择性的提取出来，系统树脂效率较高，分离每单位糖的水耗和树脂用量更低，具有换热系统，保证了进料或进水温度的稳定，从而保护粘度及温度的均匀性，同时为脱气创造条件，利用脱气将进料糖浆和洗涤液中溶解氧降到最低，具有保护树脂的效果，并且通过安全过滤能够保证机械杂质无法进入系统或者换热器。