本发明公开了一种新能源机组低碳调度控制系统及方法，预测新能源发电需求，获得新能源电网机组发电需求预测值；计算发电机组在不同功率时的联变潮流变化灵敏度矩阵，以及节点功率注入量与支路潮流间的灵敏度，按照就近原则进行机组分组；计算各机组影响因素指标，确定各分组内机组调用顺序，获得调度控制命令。本发明有效控制电网二氧化碳的排放量，以满足新能源电网低碳排放量的要求，保证新能源电网的低碳和经济运行，同时定义以最小发电成本、最小碳排放总量为目标的发电调度模型，求出最优低碳调度方案。