本发明公开了一种通过亚基定性、定量螺旋藻中藻蓝蛋白的方法，本发明依据α、β亚基条带特征将藻蓝蛋白与其他蛋白鉴别，根据α亚基条带体积计算藻蓝蛋白含量；运用十二烷基硫酸钠聚丙酰胺凝胶电泳方法，通过考马斯亮蓝染色剂，将蛋白染色为可见条带，凝胶成像系统分析藻蓝蛋白α亚基条带发光量与藻蓝蛋白含量的线性关系，最终目的为给螺旋藻提供一种准确、快速、灵敏的定性定量方法。本发明不需分离纯化藻蓝蛋白，可以单一精准测定其含量，相较于其他电泳定量方法，本发明利用α亚基条带体积作为参照条件，比条带总体积为参照条件更加灵敏，准确。