本发明公开了一种医疗器械消毒设备，包括：箱体，箱体内设有两个支撑框，箱体一侧位于两个支撑框相对位置设有密封门，密封门上设有用于对医疗器械进行翻转的翻转机构，箱体内顶部设有用于对烘干产生的蒸汽进行吸收的吸潮机构，箱体一侧设有用于对烘干产生的蒸汽进行去除的除湿机构，箱体内底部设有用于对使用后的消毒液进行过滤的过滤机构，通过本发明提出的一种医疗器械消毒设备能够带来如下有益效果：通过设置翻转机构便于使两个支撑框对消毒的医疗器械进行翻转；通过设置吸潮机构便于对箱体内顶部的蒸汽进行吸收，避免其发生凝结滴落重新落到医疗器械上，通过设置除湿机构便于对烘干产生的蒸汽进行吸收。