本发明提供了防回液的精馏塔除水系统及方法，其包括：第一温度确定模块，用于获取精馏塔内目标产品的合成温度，并基于合成温度对精馏塔进行恒温加热，得到目标产品与水蒸气的混合气体；第二温度确定模块，用于确定混合气体中目标产品与水蒸气的物理属性，并基于物理属性确定混合气体中目标产品与水蒸气的分离温度；除水模块，用于对分离温度进行调整及控制，并基于控制结果将混合气体中的水蒸气进行液化，且对液化后得到的水溶液进行疏水操作。将目标产品中包含的水分进行有效剔除，降低了对精馏塔内热量的消耗，也便于在提高目标产品的收率以及纯度的同时提升目标产品的产量。