本发明公开了一种与大豆萌发期耐盐性状相关的KASP分子标记及应用，属于分子标记技术领域。所述分子标记包括如SEQ ID NO.1所示序列和如SEQ ID NO.2所示序列中的至少一种。根据所述分子标记设计检测KASP引物组，对待测大豆样品的DNA进行荧光定量PCR扩增，利用扩增结果可判断所述大豆在萌发期是否表现为耐盐性状。本发明为大豆耐盐品种的选育提供有力的技术支持，有助于耐盐大豆的分子育种改良，与传统育种筛选相比，本发明方法可快速筛选与鉴定萌发期具有耐盐性状的大豆材料，对于减少大豆育种工作量、加速大豆育种进度具有显著的作用，对加速大豆耐盐分子育种进程有极大的意义。