本发明涉及水利工程供水拦污技术领域，具体涉及一种取水泵站用的拦污结构及其清洁方法，包括泵站塘坝的流道处设置有围构成操作井的泵站围堰，所述泵站围堰构成分别与第一泵站和第二泵站相通的第一取水通道和第二取水通道；操作井内每组进水孔组对应一个分级处理单元；所述分级处理单元包括设置有收缩吸附部的文丘里式管道，每个文丘里式管道靠近前端设置有水锤阀，后端设置有三通阀；每个所述分级处理单元的三通阀两个出口均分别与第一汇水管和第二汇水管连通；所述前堰顶部对应每个所述进水口开设有与其相通的防护腔。本发明将水锤阀和文丘里结构有机地结合，同时实现了自动吸附小型杂质或颗粒物并对已吸附的杂质定期自动进行冲刷和清洁。