本发明公开了一种水利水电工程BIM模型结构快速分割方法，该方法包括如下步骤：步骤S1：建立单向分割模板，以两个分割面和一个几何体作为输入条件，输出一个与输入几何体关联的零件；步骤S2：建立双向分割模板，以四个分割面和一个几何体作为输入条件，输出一个与输入几何体关联的零件；步骤S3：将单向分割模板和双向分割模板放入资源库中，并指定相应的逻辑名称；步骤S4：建立单向分割工程模板调用脚本；步骤S5：建立双向分割工程模板调用脚本；步骤S6：运行单向分割调用脚本或双向分割调用脚本，选择相对应的输入元素，实现对BIM模型的快速分割。本发明能够实现BIM模型的快速分割和自动化命名，同时分割后BIM模型与总体模型保持同步关联。