本发明提供的一种氟化物吸附剂的用量确定方法和系统，涉及氟化物吸附技术领域，该方法包括S1、获取含有氟化物的污水信息；S2、获取多种氟化物吸附剂的信息，所述多种氟化物吸附剂的信息包括活性炭信息、合成树脂信息和氧化铝信息；S3、基于所述含有氟化物的污水信息、多种氟化物吸附剂的信息构建四个节点和多条边，所述四个节点为氟化物的污水节点、活性炭节点、合成树脂节点、氧化铝节点，所述多条边为节点之间的连线；S4、基于所述四个节点和多条边使用图神经网络模型确定活性炭用量、合成树脂用量、氧化铝用量，该方法可以准确的确定氟化物吸附剂的用量。