本发明提供了一种耐高温、持久抗菌的树脂组合物及其制备方法和应用。以重量份计，所述树脂组合物包括丙烯酸类低聚物20～60份、丙烯酸类单体15～55份、光引发剂2～10份、纤维素纤维1～5份和季铵盐类化合物2～5份；所述纤维素纤维和季铵盐类化合物的分子结构中各自独立地含有碳碳双键。本发明中，所述树脂组合物通过各组分复配，使得材料在高温条件下仍具有优异的机械性能和抗菌性能；且稳定性好，无小分子物质析出，能够实现在高温条件下仍具有持久稳定的抗菌效果，尤其适用于齿科材料。