本发明公开了一种无臭糖厂废水促花促果生物有机肥的发酵方法，所述的发酵方法为：a、复合菌剂：糖蜜：水混合发酵；b、将a步骤制得的发酵菌液与糖蜜、制糖工业废水、水混合后搅拌，得到发酵料；c、将b步骤制得的发酵料发酵；d、加入复合菌剂二次发酵；e、将d步骤制得的发酵液与硼酸钠、EDTA‑Zn混合配制制得。复合菌剂包括链球菌、乳酸菌、芽孢杆菌、光合细菌、细丽毛壳菌、硝化细菌。本发明以制糖工业废水为主要原料，利用复合菌剂发酵除去制糖工业废水的恶臭气味并降解制糖工业废水和糖蜜中的有机质，得到的生物有机肥不仅对农作物起到促花促果的功效，还能改善土壤的微生态环境，提升土壤活力。