本发明公开一种基于多指标建模的控制棒驱动机构异常检测方法及系统，包括：获取控制棒驱动机构启动后的运行声音信号；根据设定的滑动窗长度，提取运行声音信号在每个滑动窗下的特征值指标；根据每个滑动窗下的特征值指标构建图模型，并计算相邻滑动窗的图模型的相似度，由此得到运行声音信号的得分序列；根据得分序列，判断控制棒驱动机构当前运动状态是否异常。通过提取运行声音信号的多特征值指标，并引入图模型进行建模表征，有效避免单一指标不能完全包含信号特征信息的问题，有效解决核反应堆控制棒驱动机构运行过程中异常检测的问题。