本发明涉及抗菌聚酯的制备方法、该制备方法得到的抗菌聚酯和抗菌纤维的生产方法、抗菌纤维以及抗菌纤维在生产医用外科用品中的应用。主要解决现有抗菌聚酯纤维耐洗涤抗菌性能差的缺陷，本发明通过采用一种抗菌聚酯的制备方法，包括如下步骤：（i）二元醇与二元酸进行酯化反应得酯化物料I；（ii）酯化物料I与反应型抗菌组分混合，进行预缩聚反应得预缩聚产物；（iii）预缩聚产物进行终缩聚反应得抗菌聚酯；所述反应型抗菌组分由如下式3所示的物质与二醇经过酯化反应得到；Q为含长链烃基的季铵基团，所述长链烃基中含碳原子的个数为6~20，Ar为芳环的技术方案较好地解决了该技术问题：#imgabs0#，式3。