本发明公开了一种基于改进S‑学习器的流程异常级联根因分析方法与系统，包括：1）确定流程时间异常的研究问题和异常类型；2）扩展事件日志属性；3）确定异常潜在原因和属性级联关系；4）基于改进S学习器的因果效应估计；5）潜在原因的因果效应评估与级联分析；6）根因分析结果可视化。本发明可准确定位业务流程时间异常的根本原因，定义流程时间异常研究问题和类型，扩展事件日志的时间信息和工作负载，确定异常潜在原因和属性级联关系以便于准确定位关键的根本原因，采用改进S‑学习器估计因果效应并评估根本原因。本发明给出了业务流程时间异常的根本原因及根因间的级联关系，有利于预防流程时间异常导致的风险。