本发明涉及咸潮预报技术领域，尤其涉及一种基于ConvLSTM和三维数值模拟的咸潮预报方法。所述方法包括以下步骤：获取咸潮风场数据进行历史整编分析，以得到咸潮整编历史风场集；构建三维咸潮数值模型并进行模型调整验证处理，以得到三维咸潮数值优化模型；获取三维咸潮数值优化模型参数数据并进行河床糙率提取计算和逐时面插值处理，得到咸潮河床糙率场数据集；通过ConvLSTM进行深度学习预测分析，并根据预测结果和目标预报时段的潮汐预报外海潮位成果数据利用三维咸潮数值优化模型进行三维咸潮数值模拟，得到三维咸潮预测场数据集；根据三维咸潮预测场数据集以执行相应的咸潮预报工作。本发明能够实现高精度、实时的咸潮预报。