本发明提出一种氢燃料电池系统的故障监测方法及装置，方法包括：获取样本氢燃料电池系统的各个子系统的数据；根据样本电堆数据建立电堆异常评估模型；对第一氢燃料电池系统的第一电堆进行监测，得到第一电堆监测数据；根据所述电堆异常评估模型对所述第一电堆监测数据进行分析，得到第一电堆异常评估结果；根据预设的氢燃料电池系统故障诊断模型和所述第一电堆异常评估结果确定所述第一氢燃料电池系统中存在故障的部件，得到第一故障诊断结果；根据所述第一故障诊断结果确定故障原因，并执行对应的处理方案。通过本发明方案，能够智能、高效、准确地对氢燃料电池系统进行故障监测。