一种基于保偏方式的变压器光学差动保护用光计算方法及系统，涉及继电保护技术领域。本发明是为了在差动电流光计算方案层面解决将线路保护中的光学差动保护应用在变压器保护领域存在的保护对象两侧电流相位和幅值不对应问题。本发明采用保偏方式的光计算方案，光源的出射光依次经过三个光学电流互感器，利用保偏光纤来保持各互感器入射和出射光信号的偏振状态，使最终输出光信号产生与差动电流严格成正比的旋光角；采用滤波电路检测第三光学电流互感器输出光信号的载波信号和调制波信号并计算调制比，利用调制比计算差动电流。