本发明涉及混合储能系统控制技术领域，是一种考虑冷热电多能流的多时间尺度协调控制方法及系统，其前者包括以下步骤：建立日前滚动优化控制模型，导入日前可再生能源和负荷预测结果，得到日前优化调度结果；建立日内滚动调整模型，平衡综合能源系统的各组件数据；建立实时协调控制模型，基于日内滚动调整模型对蓄电池的调度结果对混合储能系统功率分配进行调节再分配；本发明通过设置日前滚动优化控制模型、日内滚动调整模型和实时协调控制模型三个阶段来调节热力流和电力流在不同时间尺度上运行，由此将混合储能系统与综合能源系统多时间尺度优化，以平滑可再生能源的功率波动。