本发明公开了一种基于北斗短报文通信的配电网数据采集方法及系统包括，采集配电网数据北斗报文，根据北斗报文中的用户ID和公共体地址双因子校验方式确定对应的上行报文传输终端；根据上行报文传输终端建立若干个逻辑通道模型，逻辑通道模型个数由上行报文传输终端个数决定；预设令牌循环发送逻辑，根据令牌循环发送逻辑以及逻辑通道模型实现对配电网数据采集。解决了解决常规通信信号无法覆盖地区的配电网监控盲区问题，扩展配电自动化系统监控范围，解决了北斗指挥机下发短报文时的冲突问题，保证了下行报文发送的可靠性。