本发明属于电表运行维护领域，具体涉及一种电表运行误差估计方法、超差电表判断方法及系统。本发明通过去除电表轻载时的量测数据避免误差的随机分量较大的情况造成的误差波动，并且筛选相近运行状态的量测数据用于简化并代入电表运行误差远程估计模型，从而削减误差波动性在后续电能表误差求解中产生的影响，还通过将现有技术中根据筛选出正常阶段用电数据估算出的固定线损值对应的线损项改进为随用电量变化的非线性动态项来获得更加精确、更加贴合实际工况的线损估计值，代入电能表误差分析模型进行求解，进而提高估计精度，并且基于上述更加精确且贴合实际工况的线损估计值获取的精度更高的电表误差估计值，因此能够提高超差电表判断的准确性。