本发明提供一种用于深地探测的上下分离式探测仪器保护管传动机构，包括上保护管、下保护管、升降驱动组件和仪器舱，升降驱动组件包括驱动电机以及升降轴；驱动电机竖直设置与上保护管内，驱动电机输出轴下端设有一升降螺纹套，下保护管顶部设有保护套以及多个传动凸齿，仪器舱设置于保护套内，升降轴下端固定连接于保护套顶部。本发明的有益效果为：该传动机构的驱动电机可驱动升降螺纹套转动从而通过升降轴带动下保护管上升或下降。下保护管升降至顶部，可使上保护管、下保护管合拢，上保护管向下保护管传递扭矩；下保护管下降，可使上保护管、下保护管分离，从而使位于下保护管内的仪器舱露出，对地下空区进行直接探测。