本申请涉及电力系统优化调度领域，公开了一种考虑水电机组灵活启停的电力系统鲁棒调度方法及装置。所述方法构建梯级水电机组的确定性短期调度模型；根据可再生能源不确定性因素和所述确定性短期调度模型，构建电力系统短期鲁棒调度模型；对双层C&CG算法进行改进，并利用改进的双层C&CG算法对所述电力系统短期鲁棒调度模型进行迭代求解，获得调度方案。其中，所述电力系统短期鲁棒调度模型的决策变量包括水电机组启停，在考虑了可再生能源的不确定性的同时，考虑了电力系统中梯级水电机组的灵活启停，从而能进一步发挥水电的灵活调节性能。