本发明涉及物质点仿真领域，具体涉及一种用于外部非规则体模型的质点离散方法及系统，方法包括：获取第一共享文件系统，其提供有坐标访问路径、索引访问路径以分别访问顶点坐标数据及与之相关的索引数据；将网格模型拆分为局部区域并将局部区域的索引数据发送至第一节点，第一节点通过坐标访问路径查找到顶点坐标数据并将其转换为物质点数据；获取第二共享文件系统，其提供有区域、共享访问路径以分别用于供第一节点写入、第二节点采集数据，第二节点输出物质点文件。本发明采用独立索引及独立存储的数据管理方式，并配合创建有多访问路径的共享文件系统，从而提高了非规则体模型的可拆分性，并对高度拆分的数据进行准确回收。