本发明公开了一种水基钻井液用微纳米防塌封堵剂及其制备方法。封堵剂由如下质量配比的组份构成：溶胶的质量为20～50g，有机单体的质量为1～5g，阴离子表面活性剂的质量为1～10g，非离子表面活性剂的质量为1～5g，引发剂的质量为0.1～0.5g，极性溶剂的质量为10～80g，非极性溶剂的质量为10～80g。本发明中的封堵剂具有复式核壳结构，在高温条件下微纳米封堵剂的形态结构不发生任何改变，稳定性较好，溶胶中的无机纳米颗粒赋予其优秀的结构稳定性，与此同时有机单体又使其兼具一定的弹性，解决了油气开采井壁失稳问题。