本发明公开了一种枸杞中农药残留的风险评估方法及系统，涉及农业领域，解决了日常购买时无法对枸杞产品的农药残留风险进行评估和知晓的问题，风险评估方法具体如下：数据采集模块采集同一批次枸杞样本的实时样本数据；数据分析模块对不同批次的枸杞样本进行数据分析，得到不同批次枸杞样本的产品风险值或者样本异常信号；作业监测模块对不同批次枸杞样本的农药作业情况进行监测，得到不同批次枸杞样本的作业风险值；智能评定模块评估不同批次枸杞样本中农药残留的风险等级；用户终端扫描枸杞包装袋上的批次码，信息比对模块对枸杞包装袋的标识信息进行比对，本发明实现对枸杞中农药残留风险进行智能评估。