本发明涉及新能源发电技术领域，提供了一种适用于新能源发电孤网制氢的储能配置方法及系统，包括：获取新能源场站典型出力曲线，计算得到全天平均发电量；基于全天平均发电量的最大值和最小值，配置碱性电解水制氢和质子交换膜电解水制氢的电解槽负载容量；利用典型出力曲线与全天平均发电量的最大差值，配置储能装置的额定功率；基于典型出力曲线与全天平均发电量，配置储能装置的额定容量；在新能源场站运行所述典型出力曲线时，基于所述全天平均发电量与所述碱性电解水制氢的电解槽负载容量的差值，对质子交换膜电解水制氢的电解槽运行容量进行调节。在保证孤网发电量全部利用的同时也兼顾了经济性。