本发明公开了一种微纳米气泡耦合微生物菌剂修复盐碱土壤的方法，涉及盐碱土壤修复技术领域，包括以下处理方法：将盐碱土壤均匀地放置于花盆中，同时放入水稻幼苗种子。调节微纳米气泡发生器，待发生器出水口形成含有大量微纳米气泡的气水混合物后，与微生物菌剂一起加入盐碱土壤中并淹没土壤。将已处理过的盐碱土壤放入光照培养箱中，定期进行浇水灌溉等日常管理，28天后移除水稻幼苗。本发明通过使用微纳米气泡耦合微生物菌剂技术处理盐碱土壤，能够有效地降低盐碱土壤的电导率和pH值，不仅可以提高土壤肥力，促进土壤微生物的生理活性，还可以改善植物的生长发育并增强其抗逆性，实现增产增量。