本申请涉及过滤装置技术领域，具体涉及折叠纳滤膜过滤器件及其制备方法，折叠纳滤膜过滤器包括过滤层，过滤层至少包括滤膜，滤膜经打褶并首尾相连环绕成筒状，过滤层两端焊接有端盖，包括如下步骤：S1、对过滤层进行打褶处理；S2、对打褶后的过滤层进行热定型；S3、对经过热定型的过滤层进行裁切，并环绕成筒状，在首尾相连处进行封边，得到筒状过滤层；S4、在筒状过滤层的两端焊接端盖；在上述过程中，过滤层被孔径保持剂润湿，孔径保持剂沸点不低于端盖的焊接温度和过滤层的封边温度中较低的一者。在本申请中，通过对纳滤膜进行润湿，减少了封装过程中膜孔坍缩的现象，使制备得到的过滤器具有更好的通量。