本发明公开了一种鉴定果生炭疽菌的酰基转移酶easC分子标记、引物、试剂盒及应用。利用与油茶炭疽病密切相关的几种炭疽菌属真菌的全基因组序列信息进行比较基因组分析，获得果生炭疽菌特异的染色体序列和候选基因，并进一步根据候选基因可能的基因功能及是否含有内含子等特征，选定可用于特异性鉴定果生炭疽菌的候选基因作为分子标记，利用该标记对油茶果生炭疽菌进行特异性检测。本发明可用于油茶炭疽病的诊断及预测，同时可用于果生炭疽菌的特异性检测。