本发明提供了一种跨断层隧道支护结构，属于隧道跨断层抗震技术领域，包括第一支护段和第二支护段；第一支护段包括围设于隧道主体外周的第一混凝土支护层；第二支护段对应于活断层设置，包括第二混凝土支护层和缓冲嵌入体，第二混凝土支护层围设于隧道主体的外周，并衔接于第一混凝土支护层，第二混凝土支护层的外周面开设有嵌入槽，缓冲嵌入体嵌设于嵌入槽中；其中，第二混凝土支护层的韧性高于第一混凝土支护层的韧性。本发明能显著提高隧道跨断层部位的结构韧性，增强隧道结构的整体稳定性和整体承载力，在地震作用下能够更好地承受应力和变形，保证适应隧道错动变形的能力，减小地震导致的应力过大或者变形过大给隧道结构造成的影响。