本发明涉及河流溢油技术领域，公开一种河流溢油风险评估方法及系统，该方法包括：确定河流流域内资源对油污染物的环境敏感指数；确定管道发生溢油时的油品泄漏量、油品泄漏位置和油品泄漏概率；根据油品泄漏量、油品泄漏位置和油品泄漏概率，计算油污染物在河流中的扩散轨迹；根据扩散轨迹和环境敏感指数，计算各时刻河流流域溢油污染风险值，并根据预定设置的风险等级，对各时刻河流流域溢油污染风险值进行风险综合评估。本发明综合考虑了管道泄漏进入河流的可能性、污染物与受体的距离、受体敏感性，更符合河流溢油事故后果受空间和时间共同影响的特征。