本发明公开了一种核算碳排放数据的方法及系统。其中，该方法包括：实时在线监测碳排放源活动数据，采集一次能源数据、生产过程中数据以及外购电力和热力的数据；基于排放因子法，根据一次能源数据、生产过程中数据以及外购电力和热力的数据，分别计算一次能源数据的碳排放数据、生产过程中数据的碳排放数据、外购电力和热力的碳排放数据以及确定总碳排放数据；将一次能源数据的碳排放数据、生产过程中数据的碳排放数据、外购电力和热力的碳排放数据以及总碳排放数据上传到主站。该方法具有很强的可操作性，克服了现有碳排放数据核算方法存在的信息化程度低、数据真实性和实时性不足的问题。