一种含分布式光伏的配电网故障区段定位方法及系统，包括：基于获取的配电终端的告警信号确定故障发生区域及故障场景；基于光伏外汲或光伏注入反向故障电流的故障场景对告警信号按故障发生区域分区段进行校验，得到各区段的畸变信号；基于光伏外汲或光伏注入反向故障电流的故障场景对各区段的畸变信号进行修正，得到修正后的无畸变信号；基于修正后的无畸变信号进行故障定位，得到故障区段；本发明通过配电终端的告警信号初步确定故障发生区域明确分布式光伏对配电终端的影响场景；通过对光伏外汲和光伏注入反向故障电流场景下各区段畸变信号进行校验和修正，有效解决误发告警和漏发告警情况；通过矩阵算法进行精准、快速的故障区段定位。