本发明提供了一种基于北斗无电离层组合精密单点定位的海平面高反演方法，步骤S1：构建非差非组合观测值，以进行误差修正；步骤S2：构建双频无电离层组合观测值，并通过非差非组合观测值进行参数重组，以构建定位模型；步骤S3：利用卡尔曼滤波算法对定位模型进行参数估计，步骤S4：通过测站坐标、各卫星的残差序列、卫星高度角和方位角信息，选取合适的目标时段序列；步骤S5：采用隆布—史卡构法Lomb‑Scargle对各目标时段序列进行谱分析，提取最大和次最大波峰所对应的频率，当最大和次最大波峰所对应的频率求得的高差范围小于设定阈值时，则通过对应的测站高度计算海平面高度，否则重复步骤S4和S5。