本发明公开一种基于高程偏差补偿的多参考站区域对流层线性插值方法，它包括如下步骤：步骤1：对长距离参考站网进行基线解算；步骤2：提取模糊度固定解下的各条基线的双差对流层延迟；步骤3：将各条参与建模基线的对流层延迟补偿到统一的主参考站所在高程面；步骤4：采用传统的平面建模策略建模并内插出流动站与主参考站之间的对流层大气延迟；步骤5：把步骤4中内插出流动站对流层延迟再次补偿至流动站所在的高程平面；步骤6：生成流动站的虚拟观测值播发给用户；本发明可以显著提高大高差区域的对流层的建模精度以及终端RTK定位精度。