本发明公开了一种亲水抗凝涂层的制备方法：S1、制备底层溶液：取原料PEI、KH560，加入去离子水中，使原料充分反应，得到底层溶液；S2、制备氧化肝素溶液：将氧化剂溶于去离子水中，调节溶液pH值为5.5，然后加入肝素钠，原料充分反应后，旋蒸溶液并冻干，冻干得到的粉末进行纯化，将得到的氧化肝素粉末溶于去离子水中得氧化肝素溶液；S3、涂覆抗凝涂层：让待处理医用材料与底层溶液充分接触，清洗；取氧化肝素溶液，让医用材料与氧化肝素溶液接触1‑3h后，在氧化肝素溶液中加入还原剂，充分接触8‑18h，清洗，干燥，即得到亲水抗凝涂层。本发明的亲水抗凝涂层明显提升了PVC管路的抗凝血性能。