本发明涉及抗菌水凝胶技术领域，具体涉及一种抗菌水凝胶复合材料及其制备方法和应用。本发明提供的一种抗菌水凝胶复合材料，以重量份计，包括如下原料：1‑5份的纳米金属粒子、40‑45份的金属有机骨架材料、2.5‑3份的凝胶基体原料和1‑1.5份的促凝剂。本发明通过将纳米金属粒子、金属有机骨架材料、水凝胶进行结合，利用金属有机骨架的多孔性，将金属有机骨架作为纳米金属粒子的载体，既可避免纳米金属粒子的团聚，又可控制纳米金属粒子的尺寸，提高孔隙率和比表面积，进一步增强抗菌性能，从而使最终制备得到的抗菌水凝胶复合材料具有更高的抗菌效率。