本发明公开了一种水泥基渗透结晶型防水涂料及其制备方法和应用，属于水泥组合物技术领域。该防水涂层包括如下质量百分比的原料：水泥35％～45％、标准砂54％～64％、钙离子补充剂0.20％～0.30％、结晶剂0.4％～0.6％、络合催化剂0.05％～0.10％、缓凝剂0.05％～0.20％、抗渗助剂0.10％～0.40％；具有成本低廉、环保无污染、防渗性能优异的特点。本发明还提供了水泥基渗透结晶型防水涂料的制备方法，通过简单混合即可实现，工艺简便快捷。应用于混凝土基体时具有优秀的防水抗渗效果，为防水材料在建筑材料领域的良好应用提供支撑。