本发明涉及一种全氟磺酸复合质子交换膜材料的制备方法，包括以下步骤：S1，将全氟磺酸树脂溶液先涂布到底膜上，再在全氟磺酸树脂溶液上覆盖一层多孔膜，待全氟磺酸树脂溶液中的溶剂挥发后再进行下一次涂布，依次重复直至最后一次涂布的全氟磺酸树脂溶液中溶剂挥发，全氟磺酸树脂自然凝固，制备得到第一复合膜；S2，第一复合膜经过辊压处理得到第二复合膜；S3，第二复合膜经过辐照交联处理，得到全氟磺酸复合质子交换膜材料。本发明制备方法便捷简易，且制得的全氟磺酸复合质子交换膜填充度高，具有良好的力学性能、吸水稳定性和电导率。