本发明提供了一种疏水抗菌的防污聚氨酯纳米纤维膜及其制备方法，属于纳米纤维膜领域。本发明具有疏水抗菌的防污聚氨酯纳米纤维膜是表面涂覆了氟化介孔二氧化硅和季铵盐介孔二氧化硅混合材料的聚氨酯纳米纤维膜；氟化介孔二氧化硅和季铵盐介孔二氧化硅混合材料中，氟化介孔二氧化硅与季铵盐介孔二氧化硅的质量比为(0.5～1.5)：(0.5～1.5)。本发明制备的F/Q‑MSN‑PU纤维膜同时兼顾了透气性高，力学性能，优秀的稳定疏水性，以及出色抗蛋白粘附和抗细菌粘附性。具有优异的疏水稳定性；优异的抗蛋白粘附和细菌粘附的能力；出色的防污能力和自清洁能力以及优异的过滤效果。