本发明公开了一种水下化学药剂注入设备正反双向流量计量方法，包括设备本体，所述设备本体包括通过流道依次连通的药剂输入接头、降压件、针阀组件和药剂输出接头：首先以不同开度、不同流量的药剂分别进行正向和反向标定，期间同步获取药剂流经所述针阀组件前后的差压；再拟合不同开度下流量和差压的关系，得到若干开度‑流动系数数组；之后再拟合流动系数和针阀开度的关系，从而建立流量与开度‑差压的算式；最后进行实时计量。采用本发明的显著效果是，能对水下注入设备的正反双向安装情况分别进行精确流量计量，避免由于安装原因导致流量计量结果不准确。且后续仅获取差压、针阀开度参数即可得到流量，简化了实时流量的计量过程。