本发明公开了肠癌放化疗预测评分的系统及模型的应用和构建方法，其技术方案要点是，获取多个生物标志物在肠癌的肿瘤组织内以及肿瘤组织外上的荧光表达强度，所述生物标志物包括：PanCK、CD20和MHC‑II；根据所述荧光表达强度得到肿瘤组织内、肿瘤组织外及肿瘤组织内外的生物标志物的阳性率；使用逐步回归法从所有的阳性率中筛选出特征因子，根据所述特征因子构建评分模型；所述特征因子包括肿瘤组织内外MHC‑II与CD20整体双阳性率、在肿瘤组织内MHC‑II与CD20双阳性率、在肿瘤组织外MHC‑II单阳性率、在肿瘤组织外CD20单阳性率、在肿瘤组织外MHC‑II与CD20双阳性率。本发明结合肿瘤组织内和肿瘤组织外的生物标志物的阳性率，能够构建对肠癌放化疗的评分预测效果更好的评分模型。