本发明公开了一种有机农业土壤施肥方法，包括如下步骤：将开花期的油菜进行采集并进行集中放置；对开花期的油菜集中切割粉碎；将粉碎后的油菜填装进准备好的密封箱中并通过对内部喷洒水分进行保湿备用；在需要施肥的土地内部通过机械设备进行挖掘，直至挖掘出多组条状沟壑；将基础肥料进行混合制作，通过将草木灰、鸡蛋壳、干草进行混合，然后将混合完成的基础肥料中加入铜、铁、钠等化学元素的提取物；将氮、磷、钾三种化学元素的水溶液放入容器中进行混合搅拌；将提前保存的花期油菜从密封箱中取出并放置在氮、磷、钾溶液中浸泡。通过该种方法提前准备好肥料可以使普通肥料中的稀缺元素进行补充从而保证农作物的所需化学元素充沛。