本发明公开了一种分子标记LvKDZ‑S4及其在凡纳滨对虾快速生长新品系选育中的应用。所述分子标记的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示，其位于凡纳滨对虾基因组28号连锁群上的33,937,835物理位置，多态位点为C/A。在凡纳滨对虾亲本促熟阶段或更早期可通过对虾须、游泳足等活体取样的方式提取基因组DNA，然后利用55K“黄海芯1号”凡纳滨对虾液相芯片检测LvKDZ‑S4位点的基因型；再根据分型结果制定亲虾留种、交配策略。所述分子标记LvKDZ‑S4可以从分子水平上对生长快速个体进行选择，不受生长阶段和个体大小的限制，且能够在早期进行选择，提高选择的准确率和效率，加快生长速度的选育进程。