本发明属于水产生物分子鉴定技术领域，具体涉及红九棘鲈的种质鉴定引物和分子鉴定方法。所述红九棘鲈的种质鉴定引物序列如下：Ceson‑F：5’‑CACCGCAAAGTCCAGCTT‑3’；Ceson‑R：5’‑TGAAAGGGTTCCATTAGGC‑3’。所述鉴定方法包括以下步骤：（1）提取待鉴定样品的总DNA；（2）以提取的总DNA为模板，使用所述的引物进行PCR扩增，对扩增产物进行电泳；（3）根据电泳结果进行红九棘鲈种质鉴定，若观察到228bp大小的条带，则样品为红九棘鲈，若无228bp大小的条带，则为其它种。本发明简化了常规红九棘鲈种质鉴定流程，缩短鉴定所需时间，准确性较高。