本发明公开了一种运河河道生态韧性护岸结构及其施工方法，该护岸结构包括：土坡；挡墙，其设置于河道与土坡之间；注浆锚杆，土坡内设有注浆锚杆；素混凝土固土层，其铺设于土坡的表面；截水沟，土坡顶部设有截水沟和集水坑；排水管，素混凝土固土层的表面设有排水管；砌块，素混凝土固土层的表面铺设有多个相互拼接的砌块，每个砌块呈H形状，且砌块中间凹设有上大下小的凹槽，凹槽的底部设有水管预留孔；加固层，素混凝土固土层的表面与砌块之间浇筑有加固层；以及施工方法。采用本发明的护岸结构及其施工方法，结构简单，能够集防冲刷、吸能、排水、高韧性、运营维护难度低、以及低碳绿色等性能于一体。