本发明公开一种变压器直流偏磁抑制系统及方法，包括：交直流脉冲电源、磁化绕组和补偿绕组；所述交直流脉冲电源包括：电源等效电路、整流电路、第一滤波电路、逆变电路和第二滤波电路，所述电源等效电路、所述整流电路、所述第一滤波电路、所述逆变电路、所述第二滤波电路、所述磁化绕组和所述补偿绕组依次连接，所述磁化绕组和所述补偿绕组中的电流的流向相反，所述磁化绕组缠绕纳米可调磁性材料铁芯，所述补偿绕组缠绕变压器铁芯。本发明可减小直流偏磁对变压器的危害，降低或消除电网谐波污染，提高电力变压器的可靠性以及整个电力系统的稳定性。