本发明属于功能性纤维材料技术领域，具体涉及消臭复合功能性锦纶纤维及其制备方法。所述消臭复合功能性锦纶纤维的制备方法，包括以下步骤：采用偶联剂对碳酸钙和多孔物质的混合粉体进行改性，然后与锦纶切片混合，制备得到成孔‑吸附功能锦纶母粒，再与锦纶切片混合纺丝，得到初级消臭复合功能性锦纶纤维，然后依次进行甲酸溶液溶胀处理、盐酸溶液处理、空气等离子处理、功能性助剂溶液处理和络合整理液处理，得到消臭复合功能性锦纶纤维；其中功能性助剂溶液包括酞菁和绿原酸，络合整理液包括锌整理剂或铜整理剂。本发明制备的消臭复合功能性锦纶纤维，具有良好的抗菌、消臭性能，且功能稳定性高。