本发明公开了一种氢能系统监测及安全控制方法及系统，通过氢能系统和氢瓶更换安全控制系统的信息交互实现了对AGV小车装卸氢瓶的自动化控制，有效避免了人为暴力装卸氢瓶可能存在的安全问题。通过计算各港口固定机械对氢加注的紧迫值来规划AGV小车的最优氢瓶更换路径，使得能够在每个港口固定机械氢量耗尽前得到及时的氢加注。另外，AGV小车自动卸载氢瓶以换氢工作人员与氢瓶更换安全控制系统的扫码校验的信息交互为前提，对AGV小车卸载氢瓶是否正确加了一道机器结合人工的验证流程，能够确保AGV小车针对每个港口固定机械的氢瓶卸载动作不出错。