本发明属于食品安全监管技术领域。公开了一种基于数字孪生技术的食品安全监管方法及系统。所述的方法包括如下步骤：构建食品生产车间数字孪生模型；构建设备故障诊断模型；构建食品生产过程检测模型；构建食品安全监管数字孪生模型；进行设备故障诊断；进行食品生产过程检测；使用食品安全监管数字孪生模型，对设备故障诊断结果和食品生产过程检测结果进行可视化展示。所述的系统包括数字孪生模型构建模块、设备故障诊断模型构建模块、食品生产过程检测模型构建模块、模型集成模块、设备故障诊断模块、食品生产过程检测模块以及食品安全监管可视化展示模块。本发明解决了现有技术存在的实用性和实时性低，成本投入大以及效率低下的问题。